Bledian Krasniqi hat bereits als Achtjähriger bei den FCZ LetziKids mit seiner fussballerischen Ausbildung begonnen. In der Folge durchlief er beim FC Zürich sämtliche Nachwuchsstufen.

2018 Debüt in der ersten Mannschaft

Sein Debüt in der ersten Mannschaft feierte er Ende November 2018 in der Europa League gegen AEK Larnaca. Von 2019 bis 2021 war er an den FC Wil 1900 in die dieci Challenge League ausgeliehen, wo er den Durchbruch auf Profiebene schaffte. Nach seiner Rückkehr wurde er 2022 mit dem FCZ als Stammspieler Schweizer Meister.

Insgesamt bestritt Krasniqi bislang 70 Pflichtspiele für die erste Mannschaft. Zudem war er auch Mitglied sämtlicher Schweizer Nachwuchs-Auswahlen. Zuletzt stand er mit der U21-Nationalmannschaft an der EM im Einsatz und erreichte mit der Schweiz die Viertelfinals.